已测序真核生物基因组列表

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酿酒酵母是确定其完整基因组序列的第一个真核生物。

已测序真核生物基因组列表包括所有已知的,可以公开获取已组装、注释和发表的细胞核和细胞器基因组序列真核生物;基因组草图不包括在内,只有细胞器序列的物种也不包括。

1977年,第一次出现DNA测序。1995年,细菌流感嗜血杆菌第一个完成了全基因组序列。1996年,酿酒酵母是第一个发布的真核生物基因组序列。1998年,发布了第一个多细胞真核生物基因组序列,秀丽隐杆线虫

原生生物

以下是最早的5個完成基因組測序的原生生物。更完整的列表,請參閱已測序原生生物基因組列表英语List of sequenced protist genomes

植物

以下是最早的5个完成基因组测序的植物,更完整的列表,请参阅已测序植物基因组列表

物种学名 类型 意义 基因组大小 预测的基因数 完成机构 完成年份
Arabidopsis thaliana
生态型:哥伦比亚
拟南芥 模式植物 119 Mb 25,498,[1] 27,400,[2] 31,670 (UniProt) Arabidopsis Genome Initiative[3] 2000[1]
Cyanidioschyzon merolae
Strain:10D
红藻 单细胞真核生物 16.5 Mb 5,331[4] University of Tokyo, Rikkyo University, Saitama University and Kumamoto University 2004[4]
Oryza sativassp
ssp indica
大米 Crop and model organism 420 Mb 32-50,000[5] Beijing Genomics Institute、浙江大学、中国科学院 2002[5]
Ostreococcus tauri 绿藻 单细胞真核生物,基因组较小 12.6 Mb 7,969 (UniProt) Laboratoire Arago 2006[6]
Populus trichocarpa Balsam poplar or Black Cottonwood 固碳模式植物,商业木材and comparison to A. thaliana 550 Mb 45,555[7] The International Poplar Genome Consortium 2006[7]

真菌

以下是最早的5个完成基因组测序的真菌,更完整的列表,请参阅已测序真菌基因组列表英语List of sequenced fungi genomes

物种 意义 基因组大小 预测基因数目 完成机构 完成年份
釀酒酵母
Saccharomyces cerevisiae
品系:S288C
酵母菌綱 用于酿造啤酒的酵母;常用的模式生物 12.1 Mb 6,294[8] 大规模国际合作项目[9] 1996[8]
家兔脑胞内原虫
Encephalitozoon cuniculi
微孢子蟲纲 人类病原体 2.9 Mb 1,997[10] GenoscopeUniversité Blaise Pascal 2001[10]
粟酒裂殖酵母
Schizosaccharomyces pombe
品系:972h-
裂殖酵母纲 模式生物 14 Mb 4,824[11] 桑格研究所冷泉港實驗室 2002[11]
粉色麵包黴菌
Neurospora crassa
糞殼菌綱 模式生物 40 Mb 10,082[12] Broad Institute俄勒岡健康與科學大學肯塔基大学堪萨斯大学 2003[12]
黄孢原毛平革菌
Phanerochaete chrysosporium
品系:RP78
傘菌綱 木材腐朽真菌;常用于真菌修復 30Mb 11,777[13] Joint Genome Institute 2004[13]

动物

以下是最早的5个完成基因组测序的动物,更完整的列表,请参阅已测序动物基因组列表

物种 类型 意义 基因组大小 预测的基因数目 完成机构 完成年份
秀麗隱桿線蟲
Caenorhabditis elegans
品系:Bristol N2
线虫动物门 模式动物 100 Mb 19,000[14] 华盛顿大学维康桑格研究所 1998[14]
黑腹果蝇
Drosophila melanogaster
果蝇 模式动物 165 Mb 13,600[15] 塞雷拉基因組公司、加利福尼亞大學柏克萊分校貝勒醫學院、欧洲DGP 2000[15]
甘比亞瘧蚊
Anopheles gambiae
品系:PEST
疟疾载体 278 Mb 13,683[16] 塞雷拉基因組公司法国国家基因测序中心 2002[16]
红鳍东方鲀
Takifugu rubripes
四齒魨科 脊椎动物中的最小基因组 390 Mb 22–29,000[17] 国际河豚基因体协会[18] 2002[19]
智人
Homo sapiens
哺乳动物 3.2 Gb[20] 18,826(CCDS估计) 人类基因组计划委员会和塞雷拉基因組公司 草图:2001[21][22]
完成:2006[23]

参见

参考资料

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  3. ^ Arabidopsis Genome Initiative 互联网档案馆存檔,存档日期2006-02-07.
  4. ^ 4.0 4.1 Matsuzaki M; Misumi O; Shin-I T; et al. Genome sequence of the ultrasmall unicellular red alga Cyanidioschyzon merolae 10D. Nature. April 2004, 428 (6983): 653–7. Bibcode:2004Natur.428..653M. PMID 15071595. doi:10.1038/nature02398. 
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外部链接