真菌分类系统

真菌分类系统是关于真菌的科学分类法。19世纪至今，各学者对真菌的分类不尽相同，其中最常用的是安斯沃斯在1971年作出的分类系统。

贝西分类系统

1935年，恩斯特·贝西（Ernst Bessey）出版了美国第一本真菌学教科书。1950年，又出版了《真菌的形态和分类》一书，其中包含了他所创的“三纲一类”分类系统。^[1]

菌虫 Mycetozoa
藻状菌纲 Phycomyceteae
产子实体真菌类 Capormyceteae
子囊菌纲 Ascomyceteae
- 核菌 Pyrenomycetes
担子菌纲 Basidomyceteae
- 冬孢亚纲 Teliosporae
- 异担子亚纲 Heterobasidiae
- 层菌亚纲 Hymenomyceteae
- 腹菌亚纲 Gasteromyceteae
半知菌类 Imperfect Fungi
- 丛梗孢目 Moniliales
- 球壳孢目 Sphaeropsidales
- 黑盘孢目 Melanconiales

马丁分类系统

乔治·威拉德·马丁（George Willard Martin）继承了“三纲一类”的分类系统，并作了细化。^[1]

藻类 Algal group
菌类 Fungal group
- 集胞黏菌目 Acrasiales
- 网黏菌目 Labyrinthulales
- 根肿菌目 Plasmodiophorales
黏菌门 Myxomycetes
真菌门 Eumycetes
- 藻状菌纲 Phycomycetes
  - 毛菌亚纲 Trichomycetes
  - 卵菌亚纲 Oomycetes
  - 接合菌亚纲 Zygomycetes
子囊菌纲 Ascomycetes
- 半子囊菌亚纲 Hemiascomycetidae
- 真子囊菌亚纲 Euascomycetidae
- 担子菌纲 Basidiomycetes
  - 异担子菌亚纲 Heterobasidiomycetes
  - 同担子菌亚纲 Homobasidiomycetes
- 半知菌类 Fungi Imperfecti

亚历克索普洛斯分类系统

亚历克索普洛斯（Alexopoulos）对之前混乱的分类单元名称进行了规范。其1952年的分类系统沿袭了“三纲一类”的分类系统。而1962年的分类系统开始放弃“三刚一类”的分类系统，将藻状菌纲分为6纲。^[1]

亚历克索普洛斯1952年分类系统

黏菌门 Myxomycophyta
- 黏菌纲 Myxomyceteae
根肿菌纲 Plasmodiophoreae
集胞黏菌纲 Acrasieae
真菌门 Eumycophyta
藻状菌纲 Phycomycetes
- 单鞭毛菌组 Uniflagellatae
- 双鞭毛菌组 Biflagellatae
- 无鞭毛菌组 Aplanatae
子囊菌纲 Ascomycetes
- 原子囊菌亚纲 Protoascomycetes
- 真子囊菌亚纲 Euascomycetes
  - 不整子囊菌组 Plectoascomycetes
  - 果子囊菌组 Pyenomycetes
  - 盘子囊菌组 Disomycetes
担子菌纲 Basidiomycetes
- - 半担子菌亚纲 Hemibasidiomycetes
  - 无隔担子菌亚纲 Holobasidiomycetes
半知菌类 Deuteromycetes

亚历克索普洛斯1962年分类系统

真菌门 Mycota
- 黏菌亚门 Myxomycotina
  - 黏菌纲 Myxomycetes
- 真菌亚门 Eumycotina
  - 根肿菌纲 Plasmodiophoromycetes
  - 壶菌纲 Chytridiomycetes
  - 丝壶菌纲 Hyphochytriomycetes
  - 卵菌纲 Oomycetes
  - 接合菌纲 Zygomycetes
  - 毛菌纲 Trichomycetes
  - 子囊菌纲 Ascomycetes
    - 半子囊菌亚纲 Hemiascomycetidae
    - 真子囊菌亚纲 Euascomycetidae
      - 不整子囊菌 Plectomycetes
      - 核菌 Pyrenomycetes
      - 盘菌 Discomycetes
      - 虫囊菌 Laboulbeniomycetes
    - 腔囊菌亚纲 Loculoascomycetidae
- 担子菌纲 Basidiomycetes
  - 异担子菌亚纲 Heterobasidiomycetidae
  - 同担子菌亚纲 Homobasidiomycetidae
    - - 层菌 Hymenomycetes
      - 腹菌 Gasteromycetes
    - 半知菌纲 Deuteromycetes

亚历克索普洛斯1979年分类系统

真菌界 Myceteae
- 裸菌门 Gymnomycota
  - 集胞裸菌亚门 Acrasiogymnomycotina
    - 集胞菌纲 Acrasiomycets
  - 原质体裸菌亚门 Plasmodiogymnomycotina
    - 原柄菌纲 Protosteliomycetes
    - 黏菌纲 Myxomycetes
- 鞭毛菌门 Mastigomycota
  - 单鞭毛菌亚门 Haplomastigomycotina
    - 壶菌纲 Chytridiomycetes
    - 丝壶菌纲 Hyphochytridiomycetes
    - 根肿菌纲 Plasmodiophoromycetes
  - 双鞭毛菌亚门 Diplomastigomycotina
    - 卵菌纲 Oomycetes
- 无鞭毛菌门 Amastigomycota
  - 接合菌亚门 Zygomycotina
    - 接合菌纲 Zygomycetes
    - 毛菌纲 Trichomycetes
  - 子囊菌亚门 Ascomycotina
    - 子囊菌纲 Ascomycetes
      - 半子囊菌亚纲 Hemiascomycetidae
      - 不整子囊菌亚纲 Plectomycetidae
      - 层囊菌亚纲 Hemenoascomycetidae
        核菌 Pyrenomycetes
        
        盘菌 Discomycetes
      - 虫囊菌亚纲 Laboulbeniomycetidae
      - 腔囊菌亚纲 Loculoascomycetidae
  - 担子菌亚门 Basidiomycotina
    - 担子菌纲 Basidiomycetes
      - 无隔担子菌亚纲 Holobasidiomycetidae
        层担子菌 Hemenomycetes
        
        腹菌 Gasteromycetes
      - 有隔担子菌亚纲 Phragmobasidiomycetidae
      - 冬孢菌亚纲 Teliomycetidae
  - 半知菌亚门 Deuteromycotina
    - 半知菌形式纲 Deuteromycetes
      - 芽孢亚纲 Blastomycetidae
      - 丝孢亚纲 Hyphomycetidae
      - 腔孢亚纲 Coelomycetidae

安斯沃斯分类系统

安斯沃斯分类系统采用了五界系统学说，在20世纪七八十年代广泛使用。安斯沃斯分类系统与亚历克索普洛斯分类系统较相似，其区别在于建立了3个新亚门，鞭毛菌亚门、接合菌亚门和半知菌亚门，并将子囊菌分为6个纲，半知菌亚门设3个纲。^[1]

真菌界 Fungi
- 黏菌门 Myxomycota
  - 集胞黏菌纲 Acrasiomycetes
  - 黏菌纲 Myxomycetes
  - 水生黏菌纲 Hydromyxomycetes
  - 根肿菌纲 Plasmodiophoromyecetes
- 真菌门 Eumycota
  - 鞭毛菌亚门 Mastigomycotina
    - 壶菌纲 Chytridiomycetes
    - 丝壶菌纲 Hyphochytridiomycetes
    - 卵菌纲 Oomycetes
  - 接合菌亚门 Zygomycotina
    - 接合菌纲 Zygomycetes
    - 毛菌纲 Trichomycetes
  - 子囊菌亚门 Ascomycotina
    - 半子囊菌纲 Hemiascomycetes
    - 不整子囊菌纲 Plectomycetes
    - 核菌纲 Pyrenomycetes
    - 盘菌纲 Discomycetes
    - 虫囊菌纲 Laboulbeniomycetes
    - 腔囊菌纲 Loculoascomycetes
  - 担子菌亚门 Basidiomycotina
    - 冬孢菌纲 Teliomycetes
    - 层菌纲 Hymenomycetes
      - 隔担子菌亚纲 Phragmobasidiomycetidae
      - 无隔担子菌亚纲 Holobasidiomycetidae
    - 腹菌纲 Gasteromycetes
  - 半知菌亚门 Deuteromycotina
    - 芽孢纲 Blastomycetes
    - 丝孢纲 Hyphomycetes
    - 腔孢纲 Coelomycetes

卡弗利尔-史密斯分类系统

卡弗利尔-史密斯分类系统是最早体现出真菌是多界演化的分类系统之一。其将半知菌归入到其有性阶段的分类单元中。^[1]

原生动物界 Protozoa
- 菌虫 Mycetozoa
藻界 Chromista
- 具长短鞭毛门 Heterokonta
真菌界 Fungi
- 古真菌门 Archemycota
  - 壶菌纲 Chytridiomycetes
  - 毛菌纲 Trichomycetes
  - 接合菌纲 Zygomycetes
- 子囊菌门 Ascomycota
- 担子菌门 Basidiomycota

巴尔分类系统

唐纳德·J·S·巴尔（Donald J. S. Barr）1992年提出了巴尔分类系统。^[1]

原生动物界 Protozoa
- 黏菌门 Myxomycota
- 根肿菌门 Plasmodiophoromycota
藻界 Chromista
- 具长短鞭毛门 Heterokonta
  - 假菌亚门 Pseudomycotina
    - 卵菌纲 Oomycetes
    - 丝壶菌纲 Hyphochytridiomycetes
  - 网黏菌亚门 Labyrinthitina
    - 网黏菌纲 Labyrinthiomycetes
真菌界 Fungi
- 壶菌门 Chytridiomycota
- 接合菌门 Zygomycota
- 子囊菌门 Ascomycota
- 担子菌门 Basidiomycota

《真菌词典》第9版分类系统

2001年出版的《真菌词典》第9版分类系统，根据rDNA测序等技术对第8版分类系统进行了修订。将子囊菌门分成6个纲，55个目，291个科；担子菌门原有的32个目合并为16个目；担子菌类酵母菌划分到3个不同类群中。^[1]

原生动物界 Protozoa
- 黏菌门 Myxomycota
  - 网柱黏菌纲 Dictyosteliomycetes
  - 黏菌纲 Myxomycetes
  - 原柱黏菌纲 Protosteliomycetes
- 根肿菌门 Plasmodiophoromycota
  - 根肿菌纲 Plasmodiophoromycetes
藻界 Chromista
- 丝壶菌门 Hyphochytriomycota
  - 丝壶菌纲 Hyphochytridiomycetes
- 网黏菌门 Labyrinthumycota
  - 网黏菌纲 Labyrinthumycetes
- 卵菌门 Oomycota
  - 卵菌纲 Oomycetes
真菌界 Fungi
- 壶菌门 Chytridiomycota
  - 壶菌纲 Chytridiomycetes
  - 尾体菌纲 Rumpomycetes
- 接合菌门 Zygomycota
  - 接合菌纲 Zygomycetes
  - 毛菌纲 Trichomycetes
- 子囊菌门 Ascomycota
  - 子囊菌纲 Ascomycetes
  - 新床菌纲 Neolectomycetes
  - 肺炎菌纲 Pneumocyctidomycetes
  - 酵母菌纲 Saccharomycetes
  - 裂殖酵母菌纲 Schizosaccharomycetes
  - 外囊菌纲 Taphrinomycetes
- 担子菌门 Basidiomycota
  - 担子菌纲 Basidiomycetes
  - 锈菌纲 Urediniomycetes
  - 黑粉菌纲 Ustilaginomycetes

《真菌词典》第10版分类系统

2008年出版的《真菌詞典》第10版分類系統，對第9版的分類系統做了很大的調整，收錄了2001年～2008年之間的研究成果。該版將真菌界劃分7個門，底下分36綱、140目、560科、8283屬、97861種^[2]：

真菌界 Fungi
- 壶菌门 Chytridiomycota
  - ~~尾体菌纲 Rumpomycetes~~
  - 壶菌纲 Chytridiomycetes
  - 單毛壺菌綱 Monoblepharidomycetes（新）
- 芽枝霉門 Blastocladiomycota（新）
  - 芽枝霉綱 Blastocladiomycetes（新）
- 新美鞭菌門 Neocallimastigomycota（新）
  - 新美鞭菌綱 Neocallimastigomycetes（新）
- 球囊菌門 Glomeromycota（新）
  - 球囊菌綱 Glomeromycetes（新）
- 接合菌门 Zygomycota
  - ~~毛菌纲 Trichomycetes~~
  - 接合菌纲 Zygomycetes
  - 地位未定 Incertae sedis（亞界）
    - 虫霉菌亚门 Entomophthoromycotina
    - 梳霉亞門^[3] Kickxellomycotina
    - 毛霉菌亚门 Mucoromycotina
    - 捕虫霉菌亚门 Zoopagomycotina
- 子囊菌门 Ascomycota
  - ~~子囊菌纲 Ascomycetes~~
  - 盤菌亞門 Pezizomycotina（=子囊菌亞門 Ascomycotina）
    - 星裂菌綱 Arthoniomycetes（新）
    - 座囊菌綱 Dothideomycetes（新）
    - 散囊菌綱 Eurotiomycetes（新）
    - 虫囊菌纲 Laboulbeniomycetes（新）
    - 茶漬菌綱 Lecanoromycetes（新）
    - 錘舌菌綱 Leotiomycetes（新）
    - 異極菌綱 Lichinomycetes（新）
    - 圓盤菌綱 Orbiliomycetes（新）
    - 盤菌綱 Pezizomycetes（新）
    - 糞殼菌綱 Sordariomycetes（新）
  - 酵母菌亚门 Saccharomycotina
    - 酵母菌纲 Saccharomycetes
  - 外囊菌亚门 Taphrinomycotina
    - 新床菌纲 Neolectomycetes（又譯無絲盤菌綱^[4]）
    - 肺炎菌纲 Pneumocystidomycetes
    - 裂殖酵母菌纲 Schizosaccharomycetes
    - 外囊菌纲 Taphrinomycetes
- 担子菌门 Basidiomycota
  - ~~担子菌纲 Basidiomycetes~~
  - ~~锈菌纲 Urediniomycetes~~
  - 伞菌亚门 Agaricomycotina
    - 伞菌纲 Agaricomycetes（新）
    - 花耳纲 Dacrymycetes（新）
    - 银耳纲 Tremellomycetes（新）
  - 柄锈菌亚门 Pucciniomycotina
    - 伞型束梗孢菌纲 Agaricostilbomycetes（新）
    - 小纺锤菌纲 Atractiellomycetes（新）
    - Classiculomycetes Classiculomycetes（新）
    - 隱菌寄生菌纲 Cryptomycocolacomyctes（新）
    - 囊擔子菌綱 Cystobasidiomycetes（新）
    - 小葡萄菌纲 Microbotryomycetes（新）
    - 混合菌纲 Mixiomycetes（新）
    - 柄锈菌纲 Pucciniomycetes（新）
  - 黑粉菌亚门 Ustilaginomycotina（新）
    - 黑粉菌纲 Ustilaginomycetes
  - 地位未定 Incertae sedis（亞門）
    - 節擔菌綱 Wallemiomycetes（新）

後來加入的新分類

真菌界 Fungi
- 子囊菌门 Ascomycota
  - 盤菌亞門 Pezizomycotina（=子囊菌亞門 Ascomycotina）
    - 地舌菌綱 Geoglossomycetes^[5]（參自地舌菌科 Geoglossaceae，譯名待查）
  - 黑粉菌亚门 Ustilaginomycotina
    - 根腫黑粉菌綱^[3] Entorrhizomycetes^[6]
    - 外擔子菌綱^[3] Exobasidiomycetes^[7]

參見

真菌分類表（待更新）

参考文献

^ ^1.0 ^1.1 ^1.2 ^1.3 ^1.4 ^1.5 ^1.6 贺运春. 真菌学. : 65–71.
^ 賀新生. 〈《菌物字典》第10版菌物分類新系統簡介〉. 《中國食用菌》. 2009, 28 (6): 頁59-61.
^ ^3.0 ^3.1 ^3.2 王征、戴玉成. 〈真菌生命之樹項目(Assembling the Fungal Tree of Life)和美國真菌系統學研究現狀〉. 《菌物學報》. 2009, 28 (6): 頁878-887.
^ 陳今朝、圖力古爾. 〈無絲盤菌屬——中國無絲盤菌綱一新記錄屬〉. 《菌物學報》. 2009, 28 (6): 頁857-859.
^ Schoch CL, Wang Z, Townsend JP, Spatafora JW, 2009. Geoglossomycetes cl. nov., Geoglossales ord. nov. and taxa above class rank in the Ascomycota Tree of Life. Persoonia 22, 129-138.[1] （页面存档备份，存于互联网档案馆）
^ Begerow D, Stoll M, Bauer R. A phylogenetic hypothesis of Ustilaginomycotina based on multiple gene analyses and morphological data. Mycologia. 2006, 98 (6): 906–16. PMID 17486967. doi:10.3852/mycologia.98.6.906.
^ Begerow D, Stoll M, Bauer R. A phylogenetic hypothesis of Ustilaginomycotina based upon multiple gene analyses and morphological data. Mycologia. 2007, 98 (6): 906–16. PMID 17486967. doi:10.3852/mycologia.98.6.906.

[zjx-1] 1.0 ^1.1 ^1.2 ^1.3 ^1.4 ^1.5 ^1.6 贺运春. 真菌学. : 65–71.

[hxs-2] 賀新生. 〈《菌物字典》第10版菌物分類新系統簡介〉. 《中國食用菌》. 2009, 28 (6): 頁59-61.

[wangdai-3] 3.0 ^3.1 ^3.2 王征、戴玉成. 〈真菌生命之樹項目(Assembling the Fungal Tree of Life)和美國真菌系統學研究現狀〉. 《菌物學報》. 2009, 28 (6): 頁878-887.

[chentu-4] 陳今朝、圖力古爾. 〈無絲盤菌屬——中國無絲盤菌綱一新記錄屬〉. 《菌物學報》. 2009, 28 (6): 頁857-859.

[5] Schoch CL, Wang Z, Townsend JP, Spatafora JW, 2009. Geoglossomycetes cl. nov., Geoglossales ord. nov. and taxa above class rank in the Ascomycota Tree of Life. Persoonia 22, 129-138.[1] （页面存档备份，存于互联网档案馆）

[6] Begerow D, Stoll M, Bauer R. A phylogenetic hypothesis of Ustilaginomycotina based on multiple gene analyses and morphological data. Mycologia. 2006, 98 (6): 906–16. PMID 17486967. doi:10.3852/mycologia.98.6.906.

[Begerow2006-7] Begerow D, Stoll M, Bauer R. A phylogenetic hypothesis of Ustilaginomycotina based upon multiple gene analyses and morphological data. Mycologia. 2007, 98 (6): 906–16. PMID 17486967. doi:10.3852/mycologia.98.6.906.

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