Template:台灣野生動物保護區 - 维基百科，自由的百科全书

查论编中華民國野生動物保護區及重要棲息環境

北臺灣	無尾港水鳥 · 台北市野雁 · 棉花嶼、花瓶嶼 · 蘭陽溪口水鳥 · 新竹市濱海 · 雙連埤 · 桃園高榮 · 翡翠水庫食蛇龜 · 桃園觀新藻礁 · 棲蘭 · 觀音海岸

中臺灣	大肚溪口 · 櫻花鉤吻鮭 · 高美 · 丹大 · 觀霧寬尾鳳蝶 · 雪山坑溪 · 瑞岩溪 · 雲林湖本八色鳥 · 中華白海豚

南臺灣	貓嶼海鳥 · 楠梓仙溪 · 四草 · 望安島綠蠵龜產卵棲地 · 曾文溪口黑面琵鷺 · 鹿林山 · 浸水營 · 茶茶牙賴山 · 雙鬼湖 · 塔山 · 嘉義鰲鼓

東臺灣	新武呂溪魚類 · 玉里 · 丹大 · 關山 · 雙鬼湖 · 利嘉 · 海岸山脈 · 水璉

外島	馬祖列島燕鷗

參見：臺灣自然保護區域列表 · 臺灣保育物種列表