核糖核酸外切酶
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核糖核酸外切酶(Exoribonucleases)是核糖核酸(RNA)的外切酶,是一种能降解RNA,并将5'端或3'端的核苷酸移除的酶。能移除5'端核苷酸的这种酶称作“5'-3'核糖核酸外切酶”,而能移除3'端的则称作“3'-5'核糖核酸外切酶”。
此类酶有两种机理,分别是以水(水解活性)或以无机磷酸盐(磷酸解活性)去破坏RNA上的核苷酸-核苷酸键。水解核糖核酸外切酶分类在EC3.1中,因以水去降解RNA,因此生成单磷酸核苷;而以无机磷酸盐降解的则因有外在磷酸盐加在生成分子上,因此形成二磷酸核苷。
核糖核酸外切酶存在于所有生命的界别中,包括细菌、古菌及所有真核生物。能对不同类别的RNA种类作用,包括信使RNA、tRNA、核糖体RNA及微RNA。核糖核酸外切酶可简单如单个蛋白质分子的(如核糖核酸酶D和核糖核酸酶PH),亦可以复杂至包含多个蛋白质分子的外切体复合物(当中包括核糖核酸外切酶的四个家族)。
主要家族
家族 | 成员例子 | 分布 | 催化活性 |
---|---|---|---|
RNR | 核糖核酸酶R | 部分细菌及所有真核生物 | 3'-5'水解 |
核糖核酸酶II | |||
Rrp44 | |||
DEDD | 核糖核酸酶D | 部分细菌及所有真核生物 | 3'-5'水解 |
核糖核酸酶T | |||
PM/Scl-100 | |||
寡核苷酸酶 | |||
RBN | RNase BN | 部分细菌 | 3'-5'水解 |
PDX | PNPase | 所有界 | 3'-5'磷酸解 |
PM/Scl-75 | |||
核糖核酸酶PH | |||
RRP4 | Rrp4 | 所有真核生物及大部分古菌 | 3'-5'水解 |
5PX | 核糖核酸外切酶I | 所有真核生物 | 5'-3'水解 |
核糖核酸外切酶II |
参考文献
- Zuo Y, Deutscher MP. Exoribonuclease superfamilies: structural analysis and phylogenetic distribution. Nucleic Acids Res. 2001, 29 (5): 1017–26. PMC 56904
. PMID 11222749. doi:10.1093/nar/29.5.1017.
外部链接
参见
- 核酸酶(Nuclease)
- 核糖核酸酶(Ribonuclease)
- 核糖核酸内切酶(Endoribonuclease)
- 去氧核糖核酸酶(Deoxyribonuclease)
- 外切酶(exonucleases)
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