递减聚合酶链式反应
递减PCR,亦称降落PCR(英语:touchdown PCR)是一种PCR(聚合酶链式反应)方法,用来避免非特异性序列的扩增。PCR中引物的黏合温度(annealing temperature)决定了黏合的特异性,温度越高特异性越强,但过高则不能实现引物和模板的结合,而过低会产生大量非特异性产物。因此进行PCR时需要寻找合适的黏合温度。
递减PCR开始先设定一个比较高的黏合温度,每个循环黏合温度下降1℃,到一个较低温度以后每个循环的黏合温度保持不变直到结束。在刚下降到特异性结合可以进行的最高温度时,可以达到最高的特异性。这样在起初的几个循环中,特异性扩增序列可以相对非特异性序列多扩增若干倍,从而减轻非特异性扩增对结果的干扰。这种方法可用于省去多次试验最佳黏合温度的工作。
此外,递减PCR还可与简并引物(degenerate primer)结合使用,用来推出一段已知肽链的氨基酸序列所对应的DNA碱基序列。
参考文献
- Don R, Cox P, Wainwright B, Baker K, Mattick J. 'Touchdown' PCR to circumvent spurious priming during gene amplification. Nucleic Acids Res. 1991, 19 (14): 4008. PMC 328507 . PMID 1861999. doi:10.1093/nar/19.14.4008.
- Roux K. Using mismatched primer-template pairs in touchdown PCR. Biotechniques. 1994, 16 (5): 812–4. PMID 8068332.
- Hecker K, Roux K. High and low annealing temperatures increase both specificity and yield in touchdown and stepdown PCR. Biotechniques. 1996, 20 (3): 478–85. PMID 8679209.