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DNA密碼子表

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三個連續的DNA鹼基,稱為核苷酸的三聯密碼子。

傳統上,遺傳密碼RNA密碼子表的形式表示;這是因為在細胞核糖體製造蛋白質時,指導合成蛋白質的是信使RNA。信使RNA的序列則由基因組DNA確定。隨着計算生物學基因組學的興起,現今可在DNA水平上發現大多數基因,因此DNA密碼子表變得愈加有用。[1]下表中的DNA密碼子存在於有義DNA鏈上,並以5'端→3'端的方向排列。[2]

氨基酸生化性質 極性 極性 終止密碼子
標準遺傳密碼
鹼基1 鹼基2 鹼基3
T C A G
T TTT (Phe/F)

苯丙氨酸

TCT (Ser/S)

絲氨酸

TAT (Tyr/Y)

酪氨酸

TGT (Cys/C)

半胱氨酸

T
TTC TCC TAC TGC C
TTA (Leu/L)

亮氨酸

TCA TAA[B] 終止赭石 TGA[B] 終止蛋白石 A
TTG TCG TAG[B] 終止琥珀 TGG (Trp/W)色氨酸 G
C CTT CCT (Pro/P)

脯氨酸

CAT (His/H)

組氨酸

CGT (Arg/R)

精氨酸

T
CTC CCC CAC CGC C
CTA CCA CAA (Gln/Q)

穀氨酰胺

CGA A
CTG CCG CAG CGG G
A ATT (Ile/I)

異亮氨酸

ACT (Thr/T)

蘇氨酸

AAT (Asn/N)

天冬酰胺

AGT (Ser/S)

絲氨酸

T
ATC ACC AAC AGC C
ATA ACA AAA (Lys/K)

賴氨酸

AGA (Arg/R)

精氨酸

A
ATG[A] (Met/M)

甲硫氨酸

ACG AAG AGG G
G GTT (Val/V)

纈氨酸

GCT (Ala/A)

丙氨酸

GAT (Asp/D)

天冬氨酸

GGT (Gly/G)

甘氨酸

T
GTC GCC GAC GGC C
GTA GCA GAA (Glu/E)

穀氨酸

GGA A
GTG GCG GAG GGG G
A 密碼子ATG同時編碼甲硫氨酸並作為起始點:在信使RNA的編碼區里,首個ATG的出現標誌着蛋白質翻譯的開始。[3]
B ^ ^ ^ 標示終止密碼子為琥珀、赭石和蛋白石的歷史原因可在悉尼·布倫納(Sydney Brenner)的自傳[4]和鮑勃·埃德加(Bob Edgar)的一篇歷史性文章中找到。[5]
反向密碼子表(使用IUPAC符號英語nucleic acid notation縮寫)
氨基酸 密碼子 縮寫 氨基酸 密碼子 縮寫
Ala/A GCT、GCC、GCA、GCG GCN Leu/L TTA、TTG、CTT、CTC、CTA、CTG YTR、CTN
Arg/R CGT、CGC、CGA、CGG、AGA、AGG CGN、MGR Lys/K AAA、AAG AAR
Asn/N AAT、AAC AAY Met/M ATG
Asp/D GAT、GAC GAY Phe/F TTT、TTC TTY
Cys/C TGT、TGC TGY Pro/P CCT、CCC、CCA、CCG CCN
Gln/Q CAA、CAG CAR Ser/S TCT、TCC、TCA、TCG、AGT、AGC TCN、AGY
Glu/E GAA、GAG GAR Thr/T ACT、ACC、ACA、ACG ACN
Gly/G GGT、GGC、GGA、GGG GGN Trp/W TGG
His/H CAT、CAC CAY Tyr/Y TAT、TAC TAY
Ile/I ATT、ATC、ATA ATH Val/V GTT、GTC、GTA、GTG GTN
起始 ATG 終止 TAA、TGA、TAG TAR、TRA


參見

參考文獻

  1. ^ Kimball, John. The Genetic Code. Kimball's Biology Pages. 2014-05-01 [2017-02-12]. (原始內容存檔於2016-12-22). 
  2. ^ Shu, Jian-Jun. A new integrated symmetrical table for genetic codes. BioSystems. January 2017, 151: 21–26. Bibcode:2017arXiv170303787S. PMID 27887904. arXiv:1703.03787可免費查閱. doi:10.1016/j.biosystems.2016.11.004. 
  3. ^ Nakamoto T. Evolution and the universality of the mechanism of initiation of protein synthesis. Gene. March 2009, 432 (1–2): 1–6. PMID 19056476. doi:10.1016/j.gene.2008.11.001. 
  4. ^ Brenner S. A Life in Science (2001) Published by Biomed Central Limited ISBN 0-9540278-0-9 see pages 101-104
  5. ^ The genome of bacteriophage T4: an archeological dig. Genetics. 2004, 168 (2): 575–82. PMC 1448817可免費查閱. PMID 15514035. 

外部連結