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二氫尿苷

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二氫尿苷
IUPAC名
1-[(2R,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-1,3-diazinane-2,4-dione
別名 5,6-dihydrouridine
1,3,5,6-tetrahydrouridine
識別
CAS號 5627-05-4  checkY
PubChem 94312
ChemSpider 85115
SMILES
 
  • C1CN(C(=O)NC1=O)[C@H]2[C@@H]([C@@H]([C@H](O2)CO)O)O
InChI
 
  • 1/C9H14N2O6/c12-3-4-6(14)7(15)8(17-4)11-2-1-5(13)10-9(11)16/h4,6-8,12,14-15H,1-3H2,(H,10,13,16)/t4-,6-,7-,8-/m1/s1
InChIKey ZPTBLXKRQACLCR-XVFCMESIBI
性質
化學式 C9H14N2O6
摩爾質量 246.217 g/mol g·mol⁻¹
若非註明,所有數據均出自標準狀態(25 ℃,100 kPa)下。

二氫尿苷(英語:Dihydrouridine,或稱為5,6-二氫尿嘧啶核苷,縮寫D[1]DHUUH2)是一種嘧啶核苷,由核鹼基5,6-二氫尿嘧啶核糖通過C-N糖苷鍵連結而成,比常見的尿苷多了兩個氫原子,使其嘧啶環上不存在碳碳雙鍵,常見於rRNAtRNAD環),影響其RNA結構

腺嘌呤二氫尿嘧啶組成的鹼基互補配對(A:D)

由於二氫尿嘧啶沒有5(6)處的雙鍵,使得六元環不在一個平面上,D的存在擾亂了RNA螺旋與堆疊結構的穩定性。[2]

許多在極低溫度下生活的生物(嗜冷生物)的tRNA有着較高的5,6-二氫尿嘧啶的比例(比通常的大了40-70%),增加了tRNA在低於水的冰點下的柔韌性與適應性[3]

參考文獻

  1. ^ IUPAC-IUB Commission on Biochemical Nomenclature. Abbreviations and symbols for nucleic acids, polynucleotides, and their constituents. Biochemistry. 1970, 9 (20): 4022–4027. doi:10.1021/bi00822a023. 
  2. ^ Dalluge JJ; Hashizume T; Sopchik AE; McCloskey JA; Davis DR. Conformational flexibility in RNA: the role of dihydrouridine. Nucleic Acids Res. Mar 15, 1996, 24 (6): 1073–1079. PMC 145759可免費查閱. PMID 8604341. doi:10.1093/nar/24.6.1073. 
  3. ^ Dalluge JJ; Hamamoto T; Horikoshi K; Morita RY; Stetter KO; McCloskey JA. Posttranscriptional modification of tRNA in psychrophilic bacteria. J Bacteriol. March 1, 1997, 179 (6): 1918–1923. PMC 178914可免費查閱. PMID 9068636.