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深海病毒科

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深海病毒科
病毒分类 编辑
(未分级) 病毒 Virus
域: 核糖病毒域 Riboviria
界: 正核糖病毒界 Orthornavirae
门: 小核糖病毒门 Pisuviricota
纲: 小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes
目: 套式病毒目 Nidovirales
科: 深海病毒科 Abyssoviridae
属: 甲型深海病毒属 Alphaabyssovirus
亚属与种
  • 甲型深海病毒属(Alphaabyssovirus
    • 海兔深海病毒一型(Aplysia abyssovirus 1

深海病毒科学名:Abyssoviridae)是网巢病毒目的一个,为具包膜正单链RNA病毒,本科为一单型分类单元,仅包含甲型深海病毒属Alphaabyssovirus)一个属,该属亦为单型,仅有海兔深海病毒一型Aplysia abyssovirus 1,AAbV)一种[1],为感染加州海兔英语California sea hare的病毒,由美国国家生物技术信息中心(NCBI)公开的转录组霰弹枪序列组装(transcriptome shotgun assembly) 与表现序列标签英语expressed sequence tag数据库中经BLAST比对发现,于2018年发表[2]

命名

深海病毒科的学名得名自英文的"abyss"(意指“深渊”),除了指本科病毒感染的宿主海兔生存于海洋外,还指传说中居于地下深处的苏美神祇阿勃祖,亦指此病毒为透过深度测序英语Coverage (genetics)技术自序列数据库中发现[2]

病毒学

加州海兔

海兔深海病毒一型的基因组长35,913nt,为已知RNA病毒中基因组大小次大者,仅次于同属网巢病毒目之涡虫分泌细胞网巢病毒(PSCNV)的41,103nt[2][3]。AAbV的基因组包含两个开放阅读框(ORF),一为典型网巢病毒的ORF1a与ORF1b融合而成,一为其3'端编码结构蛋白的开放阅读框ORF2,另外还有长74nt的5'UTR与长964nt的3'UTR[2]

相较于其他网巢病毒的ORF1a与ORF1b间有一促进-1核糖体移码的序列,AAbV的ORF1中与ORF1a和ORF1b同源的区域间有一同框的终止密码子UGA与一促进翻译连读的序列,使部分核糖体翻译至此时发生连读而继续翻译ORF1b的序列,以此调控ORF1b编码蛋白的表现[2]

参考文献

  1. ^ Virus Taxonomy: 2018 Release. International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). October 2018 [26 January 2019]. (原始内容存档于4 March 2018). 
  2. ^ 2.0 2.1 2.2 2.3 2.4 Bukhari, Khulud; Mulley, Geraldine; Gulyaeva, Anastasia A.; Zhao, Lanying; Shu, Guocheng; Jiang, Jianping; Neuman, Benjamin W. Description and initial characterization of metatranscriptomic nidovirus-like genomes from the proposed new family Abyssoviridae, and from a sister group to the Coronavirinae, the proposed genus Alphaletovirus.. Virology. 2018, 524: 160–171. ISSN 0042-6822. OCLC 7856217008. PMC 7112036可免费查阅. PMID 30199753. doi:10.1016/j.virol.2018.08.010可免费查阅 (英语). 
  3. ^ Saberi, Amir; Gulyaeva, Anastasia A.; Brubacher, John L.; Newmark, Phillip A.; Gorbalenya, Alexander E. A planarian nidovirus expands the limits of RNA genome size. PLOS Pathogens. 2018-11-01, 14 (11): e1007314. PMC 6211748可免费查阅. PMID 30383829. doi:10.1371/journal.ppat.1007314.