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454生物科學

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454生物科學是位於美國康涅狄格州生物技術公司。他們的主要產品是高通量DNA測序技術。

技術

454使用的是一種類似焦磷酸測序法的創新的DNA測序方法。他們於2003年向GenBank提交了一個腺病毒全序列[1],使得他們的技術成為桑格測序法後第一個被用來測生物基因組全序列的新方法。他們的方法有着相當高的讀取速度,大約為5小時可以測兩千萬鹼基對[2]

優點和缺點

454的技術的最大優點在於,讀取速度很高,而且成本相對很低。富含G-C的區域也不會影響測序效果。但是每個讀取過程只能獲得大約100鹼基對的長度,使得從大量DNA序列片段到組裝好的基因組全序列的過程變得很艱難,特別是當被測生物基因組裡面有大量重複序列的時候。同時該方法處理比較長的同聚物時也有自身的問題,例如很難以高的可信度將7個A和8個A區分開來[3]

參考文獻

  1. ^ Lauer, KP; Llorente, I; Blair, E; Seto, J; Krasnov, V; Purkayastha, A; Ditty, SE; Hadfield, TL; Buck, C; Tibbetts, C; Seto, D. Natural variation among human adenoviruses: genome sequence and annotation of human adenovirus serotype 1.. The Journal of general virology. 2004-09, 85 (Pt 9): 2615–2625. PMID 15302955. doi:10.1099/vir.0.80118-0. 
  2. ^ 存档副本. [2006-11-17]. (原始內容存檔於2006-10-29). 
  3. ^ 454生物科學

外部連結