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生命條形碼數據系統

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生命條形碼數據系統(英語:Barcode of Life Data System,也稱作 BOLDBOLD系統)是專門用於DNA條形碼的WEB平台。[1][2]它是由加拿大生物多樣性基因組學中心開發的基於雲數據的DNA存儲分析平台。它分別由四個模塊組成:數據入口,教育入口,一個BINs(假定物種)註冊中心,以及一個數據收集和分析工作枱,該工作枱為分析DNA序列提供在線平台。[2] 自2005年推出後,生命條形碼數據系統增加了一系列功能(包括數據組織、數據驗證、可視化數據和數據發表)。該系統的最新版本(第四版)於2017年推出,該版本改進了支持數據收集與分析的工具,(也改進了數據發佈、引用和註釋工具)。[3] 截至2020年11月16日,生命條形碼數據系統已包含了18105種擁有正式名稱的物種條形碼序列(包括動物、植物、真菌與原生生物)(約890萬個標本)。[4]

任何對DNA條形碼感興趣的研究員都可免費下載生命條形碼數據系統。通過此產品的專門服務,它有助於發表符合國際核苷酸序列數據庫中獲得條形碼標準的記錄。由於其基於web的交付方式和高度靈活的數據安全系統,它還能有效支持需廣泛研究的團隊項目。[3]

BOLD的數據主要來自國際生命條形碼協會(iBOL)從2010年至2015年間的項目「BARCODE 500K」。 該項目旨在獲取五十萬至五百萬種標本的DNA條碼記錄數據。信息的分類均由來自世界各國的科學家,合作者和設施進行。數據的積累提高了DNA條碼識別的精準度,並有助於實現生命條形碼數據庫的擴充。

參考文獻

  1. ^ Ratnasingham, Sujeevan; Hebert, Paul D. N. A DNA-Based Registry for All Animal Species: The Barcode Index Number (BIN) System. PLoS ONE. 2013, 8 (7): e66213. ISSN 1932-6203. doi:10.1371/journal.pone.0066213. 
  2. ^ 2.0 2.1 RATNASINGHAM, SUJEEVAN; HEBERT, PAUL D. N. BARCODING: bold: The Barcode of Life Data System (http://www.barcodinglife.org). Molecular Ecology Notes. 2007-01-24, 7 (3): 355–364. ISSN 1471-8278. doi:10.1111/j.1471-8286.2007.01678.x. 
  3. ^ 3.0 3.1 BOLD Print Handbook for BOLD v4. www.boldsystems.org. [2020-11-16]. (原始內容存檔於2021-04-23). 
  4. ^ Kingdoms of Life Being Barcoded | BOLDSYSTEMS. www.boldsystems.org. [2020-11-16]. (原始內容存檔於2021-04-16). 

外部連結