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假单胞菌门

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假单胞菌门
扫描式电子显微镜(SEM)下的大肠杆菌
科学分类 编辑
域: 细菌域 Bacteria
门: 假单胞菌门 Pseudomonadota
异名
  • "Proteobacteria" Gray and Herwig 1996
  • "Proteobacteria" Garrity et al. 2005
  • "Alphaproteobacteraeota" Oren et al. 2015
  • "Epsilonbacteraeota" Waite et al. 2017
  • "Myxococcota" Waite et al. 2020
  • "Bdellovibrionota" Waite et al. 2020
  • Campylobacterota Waite et al. 2021
  • "Campylobacterota" Waite et al. 2018
  • Myxococcota Waite et al. 2021
  • Bdellovibrionota Waite et al. 2021
  • "Alphaproteobacteriota" Whitman et al. 2018

假单胞菌门[1][2](学名:Pseudomonadota)旧名变形菌门[3](Proteobacteria)[4]细菌中主要的一,包括很多病原菌,如大肠杆菌克雷伯氏菌沙门氏菌志贺氏菌绿脓杆菌霍乱弧菌鼠疫杆菌脑膜炎双球菌淋球菌空肠弯曲菌幽门螺杆菌等著名的[5]也有自由生活(非寄生)的种类,包括很多可以进行固氮的细菌。

卡尔·乌斯于1987年建立这个群组,非正式的称这是“紫细菌及其亲属”。[6]假单胞菌门主要是由核糖体RNA序列定义的,名称取自希腊神话中能够变形的神普罗透斯(这同时也是变形菌门中变形杆菌属的名字),因为该门细菌的形状具有极为多样的形状。[7][8]

特性

所有的假单胞菌门细菌都是革兰氏阴性菌,其外膜主要由脂多糖组成。很多种类利用鞭毛运动,但有一些非运动性的种类,或者依靠滑行来运动。此外还有一类独特的黏细菌(myxobacteria),可以聚集形成多细胞的子实体。假单胞菌门包含多种代谢种类。大多数细菌营兼性或者专性厌氧异养或者自养化能生物生活,但有很多例外。很多并非紧密相关的属可以利用光合作用储存能量。因其多数具有紫红色的色素,被称为紫细菌

分类

假单胞菌门根据rRNA序列被分为五类(通常作为五个纲),用希腊字母α、β、γ、δ和ε命名。其中有的类别可能是并系的。

α-变形菌除包括光合的种类外,还有代谢C1化合物的种类、和植物共生的细菌(如根瘤菌属)、与动物共生的细菌和一类危险的致病菌立克次体目。此外真核生物的线粒体的前身也很可能属于这一类(参见内共生学说)。

β-变形菌包括很多好氧或兼性细菌,通常其降解能力可变,但也有一些无机化能种类(如可以氧化氨的亚硝化单胞菌属(Nitrosomonas))和光合种类(红环菌属(Rhodocyclus)和红长命菌属(Rubrivivax))。很多种类可以在环境样品中发现,如废水或土壤中。该纲的致病菌有奈氏球菌目(Neisseriales)的中一些细菌(可导致淋病脑膜炎)和伯克氏菌属(Burkholderia)。 在海洋中很少能发现β-变形菌。

γ-变形菌包括一些医学上和科学研究中很重要的类群,如肠杆菌科(Enterobacteraceae)、弧菌科(Vibrionaceae)和假单胞菌科(Pseudomonadaceae)。很多重要的病原菌属于这个纲,如沙门氏菌属(Salmonella)(肠炎和伤寒)、耶尔辛氏菌属(Yersinia)(鼠疫)、弧菌属(Vibrio)(霍乱)、绿脓杆菌(Pseudomonas aeruginosa)(就医时引发的肺部感染或者囊性纤维化)。重要的模式生物大肠杆菌也属于此纲。

δ-变形菌包括基本好氧的形成子实体的黏细菌和严格厌氧的一些种类,如硫酸盐还原菌脱硫弧菌属(Desulfovibrio)、脱硫菌属(Desulfobacter)、脱硫球菌属(Desulfococcus)、脱硫线菌属(Desulfonema)等)和硫还原菌(如除硫单胞菌属(Desulfuromonas)),以及具有其它生理特征的厌氧细菌,如还原三价铁的地杆菌属(Geobacter)和共生的暗杆菌属(Pelobacter)和互营菌属(Syntrophus)。

ε-变形菌只有少数几个属,多数是弯曲或螺旋形的细菌,如沃林氏菌属(Wolinella)、螺杆菌属(Helicobacter)和弯曲菌属(Campylobacter)。它们都生活在动物或人的消化道中,为共生菌(沃林氏菌在牛中)或致病菌(螺杆菌在胃中或弯曲菌在十二指肠中)。

参见

参考文献

  1. ^ Pseudomonadota. 台湾生命大百科. 
  2. ^ 郭浩然,王帆,田连祥,等.山西运城盐湖土壤沉积物细菌多样性及影响因素分析[J].微生物学报, 2024(6).
  3. ^ 變形菌門. 乐词网. 国家教育研究院.  (繁体中文)
  4. ^ 存档副本. [2022-04-23]. (原始内容存档于2022-06-01). 
  5. ^ Madigan, M. and J. Martinko. (eds.). Brock Biology of Microorganisms 11th. Prentice Hall. 2005. ISBN 0-13-144329-1. 
  6. ^ Woese, CR. Bacterial evolution. Microbiological reviews. 1987, 51 (2): 221–71. PMC 373105可免费查阅. PMID 2439888. 
  7. ^ Stackebrandt, E.; Murray, R. G. E.; Truper, H. G. Proteobacteria classis nov., a Name for the Phylogenetic Taxon That Includes the "Purple Bacteria and Their Relatives". International Journal of Systematic Bacteriology. 1988, 38 (3): 321. doi:10.1099/00207713-38-3-321. 
  8. ^ Proteobacteria. Discover Life: Tree of Life. [2007-02-09]. (原始内容存档于2007-09-27). 

外部链接